老铁们,大家好,相信还有很多朋友对于植物大战僵尸基因编辑器怎么用和mvista怎么使用的相关问题不太懂,没关系,今天就由我来为大家分享分享植物大战僵尸基因编辑器怎么用以及mvista怎么使用的问题,文章篇幅可能偏长,希望可以帮助到大家,下面一起来看看吧!
一、ncbi上下载基因数据怎么取消空行
要在NCBI上下载基因数据并取消空行,可以使用编程语言(如Python)来处理数据。首先,下载基因数据并保存为文本文件。然后,使用文件处理方法(如读取和写入文件)来逐行读取数据,并检查每行是否为空行。如果是空行,则跳过该行;如果不是空行,则将其写入新的文件中。最后,保存新的文件即可。这样就可以取消空行并保留有效的基因数据。
二、mvista怎么使用
使用中的几点心得:
1、除了在线版的,我们还可以在网站上填写信息申请离线的软件。需要先自己比对,然后要按照一定的格式来制作文件,当然你还必须得安装java才能运行软件;总之,感觉没有在线版的方便。
2、mVISTA的web服务器声明也接受GFF3格式的注释。
NCBI网站上可以下载GFF3格式的文件,
注意:下载后导入mVISTA,结果显示只注释了前面一半的基因,后一半序列没有注释。所以,后来就在网上下了一个perl脚本,来自于简书的《mVISTA格式文件:由Perl脚本处理GenBank注释文件而来》,然后把NCBI上下载的参考序列的gb文件转换成了mVISTA格式文件,注释的这个问题就算解决了。
3、VISTABrowser打不开(用IE浏览器打开,网页直接就未响应,可能是我电脑计算力太低了?搞不懂),直接下载的pdf结果。pdf格式是矢量图格式(之前的文章里讨论过矢量图与位图的区别),因此就可以尽情编辑啦,只要你用的pdf编辑器有编辑功能
好了,文章到此结束,希望可以帮助到大家。
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